So finden Sie die Aminosäuresequenz

Was ist Aminosäure?

Aminosäuren sind die Grundbausteine ​​aller Proteine ​​in unserem Körper. Sei es ein Hormon, ein Enzym, ein Strukturprotein wie Keratin, alle bestehen aus Aminosäuren. Aminosäuren polymerisieren zur Herstellung von Proteinen. Da jede Aminosäure ein basisches -NH2-Ende und ein saures -COOH-Ende aufweist, reagieren diese Enden miteinander und bilden eine Aminosäurekette, die als Polypeptid bezeichnet wird. Ein Polypeptid kann eine Vielzahl von Aminosäuren enthalten. Abhängig von der Reihenfolge der Aminosäuren, die auch als Aminosäuresequenz bezeichnet wird, können sich Proteine ​​voneinander unterscheiden. Die Sequenzierung ist von größter Bedeutung, da sie bestimmt, ob das Protein ordnungsgemäß funktioniert oder nicht.

Aminosäuren polymerisieren nicht statistisch. Dieser Prozess ist stark reguliert. Der Code jedes Proteins wird in einer DNA-Sequenz gespeichert, die zuerst in eine m-RNA-Sequenz transkribiert wird (in höheren Organismen wird DNA gespleißt, bevor sie in m-RNA umgewandelt wird, wo die unerwünschten DNA-Sequenzen, die zwischen den Genen liegen, entfernt werden) und dann RNA wird in eine Aminosäuresequenz übersetzt. 

(A = Adenin, T = Thymin, G = Guanin, C = Cytosin, U = Uracil in m-RNA t wird durch U ersetzt)

Wenn wir DNA als ein aus vier Buchstaben bestehendes Alphabet betrachten und aus drei Buchstaben bestehen können, werden diese Wörter aus drei Buchstaben Codons genannt. Jedes dieser Codons steht für eine bestimmte Aminosäure. Wenn eine DNA-Sequenz oder eine m-RNA-Sequenz bereitgestellt wird, können wir daher möglicherweise die Aminosäuresequenz vorhersagen. Das eigentliche Problem ist, da es sich bei DNA um ein lineares Array von Informationen handelt, sollten wir einige Regeln haben, um an der richtigen Position zu beginnen und zu stoppen.

Einige Schritte zum Auffinden der Aminosäuresequenz

• SCHRITT 1  - Wissen Sie, welcher DNA-Strang gegeben wird. Es gibt zwei Stränge: Codierstrang oder nichtcodierender Strang.

 

Man kann entweder den kodierenden Strang von 3 'bis 5' lesen oder den Template-Strang von 5 'nach 3' lesen, wenn der entsprechende m-RNA-Strang hergestellt wird.

• SCHRITT 2 - Schreiben Sie den entsprechenden m-RNA-Strang.

Codingstrang verwenden: (A = U, T = A, G = C, C = G) Lesen Sie von links nach rechts

Schablonenstrang verwenden: (T = U) Von links nach rechts lesen

Wir können sehen, dass wir unabhängig vom verwendeten Strang dieselbe Sequenz erreichen.

• SCHRITT 3 - Konvertieren Sie m-RNA als Sequenz von Codons. Beginnen Sie IMMER mit dem Codon AUG und zählen Sie NIE zweimal das gleiche Nukleotid!

• SCHRITT 4 - Verwenden Sie die nachstehende Tabelle, um die relevante Aminosäuresequenz zu finden.

Denken Sie auch daran,
ein. Startcodon AUG steht für Methionine.
b. Wenn Sie auf ein Stoppcodon UAA, UGA, UAG stoßen, sollten Sie die Sequenzierung beenden.

Prüfen Sie, ob Sie die unten gezeigte Antwort erhalten:

Met-Leu- Asp-Val-Phe-STOP